Dès 2001, une dizaine de Centres de jeunes de Wallonie picarde, affiliées aux deux principales fédérations du secteur (la FCJMP et la FMJ), décide d’organiser des rencontres entre animateurs pour échanger sur leurs réalités de travail. Il s'agit principalement de Maisons de jeunes (MJ) et d'un Centre de rencontre et d'hébergement (CRH). Ils souhaitent ainsi partager leurs expériences et décloisonner les actions de chaque Centre de jeunes. Le partage d'expérience permet aux coordonnateurs et animateurs de sortir de leur isolement et de réfléchir ensemble aux solutions à apporter aux problématiques qu'ils rencontrent et qui s'avèrent le plus souvent similaires. Des rencontres s’organisent alors de manière assez régulière. 

Rapidement, des échanges sont mis sur pied autour d’activités organisées habituellement au sein des Centres de jeunes. Des rencontres sportives et ludiques, des concerts ou encore un travail autour de ce qu'on appelle à l'époque les nouvelles technologies de l'information et de la communication. Les jeunes se rencontrent et découvrent l’existence d’autres Centres de jeunes que leur ainsi que les activités développées par chacune d'elles. 

Après 10 ans d’actions communes, le Collectif choisit de se doter d’un nom et d’un logo commun avec la volonté de renforcer l'identité des Centres de jeunes aux quatre coins du territoire. Le logo intègre la carte de la Wallonie picarde et l'acronyme Wapi, pour rappeler l'ancrage local des Centres de jeunes ; ainsi que les initiales CJ pour "Centres de jeunes". On y retrouve également l’appellation complète, et enfin le suffixe ".be"

En 2013, les 2 deux Centres d'information jeunesse de la région rejoignent ensemble le Collectif.

La même année, soucieux d'améliorer la communication interne et externe du Collectif, une première cellule de travail, constituée de plusieurs membres, voit le jour. 

Le CJWapi prend de l'ampleur et multiplie les actions collectives ; ce qui l'amène progressivement à se structurer autour d'une charte de fonctionnement. Cette charte a été adoptée lors d'une journée carrefour, organisée autour de tables thématiques sur la communication, rassemblant pour la première fois tous les travailleurs des Centres de jeunes de la Wallonie picarde. Dès ce moment, le Collectif structure son action aux travers de Cellules. La Cellule Réfl'action offre un espace de partage d'expériences. La Cellule Animation, essentiellement composées d'animateurs, organise des animations thématiques ayant pour objectif de faire se rencontrer les jeunes. Pour finir, la Cellule Communication travaille sur la mise en réseau entre les Centres de jeunes afin de renforcer la reconnaissance et la visibilité des actions des Centres de jeunes en Wallonie Picarde. Des réunions plénières organisées mensuellement servent à coordonner les actions des différentes cellules.

En 2014, le Collectif créera le Wapicyclette. Un camp itinérant à vélo ponctué d’animations, mais aussi d’actions citoyennes ; rassemblant plus de 70 jeunes issus des différents Centres de jeunes partenaires. Cette initiative créée une dynamique tout à fait nouvelle au sein du Collectif en renforçant les accointances entre les animateurs des différents centres de jeunes et en créant des liens forts entre les jeunes issus de ces mêmes Centres. Une aventure qui sera renouvelée chaque année, avec de nombreuses variations dans les parcours et les actions, jusqu'en 2020.

Cette même année, est créée la Cellule média qui donnera naissance aux médiareporters dont la mission principale sera de valoriser par les jeunes les actions des différents Centre de jeunes.

L'année 2015 voit le collectif s'agrandir à 14 membres avec l'arrivée d'un Centre d'Information jeunesse et de l'autre Centre de rencontre et d'hébergement de Wallonie picarde. Tous les Centres de jeunes reconnus et subventionnés de la Wallonie picarde à cette époque sont alors représentés au sein du Collectif. 

L'année suivante, le Collectif formalise son action en se dotant d'un plan d'action quadriennal commun construit autour de 3 axes principaux. Ce plan vise à renforcer la professionnalisation des équipes, à développer des animations communes et participatives au profit des jeunes des différents Centres de jeunes de la Région et à visibiliser l'action des Centres de jeunes. Chaque année, de nouvelles journées carrefour thématiques sont organisées, renforçant de la sorte l'action et la dynamique collective du CJWapi.

En 2017, le CJWapi passe à 15 membres en accueillant un nouveau Centre de jeunes en demande de reconnaissance auprès de la Fédération Wallonie-Bruxelles. Reconnaissance qu'il obtiendra en 2021. Le CJWapi est alors le plus grand collectif de la Fédération Wallonie-Bruxelles rassemblant sas exception l'ensemble des Centres de jeunes reconnus.

En 2020, le Collectif souhaite améliorer son fonctionnement et organise ses États généraux avec l'ensemble des animateurs du Collectif. Au terme de processus d'introspection, le CJWapi revoit son organisation et se dote d'un nouveau plan d'action.